今天，很难确定蘑菇种植最早始于哪个国家，哪个时间。有些作者认为蘑菇种植起源于法国，有些认为属于意大利，然后法国沿袭它们的经验。最有意义的是荷兰作家Peter Vedder 1978 写的《现代蘑菇种植》，在食用菌种植方面有相当多的科学依据。他指出蘑菇在1650年在法国的Vicinities 附近首次被发现。农民们意外の发现一些蘑菇长在种过瓜的地方。他们还发现在被洗过蘑菇的水淋到的粪便周围会长更多的蘑菇。他们不知道是什么原因，所以他们只是注意到这种现象。另外他们还发现蘑菇能种在院子的驴马粪肥上，当瓜地蘑菇成熟后清洗过的水浇到这些粪物上。
1651年 Bonnefonce 发表《不能种在花园里的田间蘑菇》。1707年，法国植物学家Turnefore 描述了一种利用马粪种植蘑菇的方法，而这种方法之前也种植过蘑菇，即用新鲜制作的基质作为播种材料。
1731年，法国的种植方式通过miller出版的《花园手册》而传播到英国。此书的德语版也在1769年出版。
1754年，一个瑞典人Lundberg提出全年可以种植蘑菇的建筑结构描述。
1865年，蘑菇种植从英国传播到美国，一开始，只是小范围的种植蘑菇。1870年，蘑菇行业开始大规模发展起来。同时，也在世界范围内迅速传开。
在俄罗斯，蘑菇种植在18世纪中期开始。1780年，一位著名的农作园艺师 A.T. Bolotov 在经济杂志上公开《关于蘑菇的一些事》的文章。有证据表明，在十九世纪二十年代，农民Osinin 在这个为特殊用途所建造的房间内少量种植蘑菇。
从1848年开始，一个著名的圣彼得堡司机开始进行工业化种植食用菌。1860-1861年他在《俄罗斯园艺先驱报》上发表了关于食用菌种植的文章。
三个世纪来食用菌种植有了长足的发展，种植方式和技术都在不断进步。早年，采用之前床架上长满的含菌丝的堆肥作为播种材料。当然，用这种方法病虫灾害不断出现，农民也时常没有较好的收成。19世纪末出现了一种从双孢菇孢子中提取菌丝作为纯培养基的方法。法国人康斯坦丁和马特鲁辛（Matroushot)是首次能够利用孢子繁殖蘑菇，当时这种种植方式是秘密进行的。但到1902年，一位美国研究者弗格森 Fergusson公布了孢子繁殖和菌丝生长的所有细节。1905年，杜格鲁（Douggarou),一位美国人，从菇盖组织中获取了菌丝体。因此，在20世纪初美国就有了专门从事菌种生产的公司。菌丝体装入含有灭菌堆肥的瓶子里被运送给蘑菇种植者。一个较大的优点是蘑菇种植者能预先知道是哪种菇。此外，采用无病虫害的菌丝体可以降低产量损失的风险。
1932年，Sinden申请了谷物菌丝体备制的专利，同时，他开始开发新的蘑菇品种。另外一个重大发展进步是由美国人蓝宝（Lambert)将蘑菇堆肥分为两个阶段。第二阶段 - 巴氏消毒是在菇房内进行，这极大的保证了堆肥的无病虫害。后来，Sinden和Hauser 研究者开发了一种short堆肥的方法，这种方法到现在仍在全世界被广泛运用。
更多关于从古希腊到现在的食用菌种植历史能在一本199年8由著名作家 Lydia Vasilievna Garibova 教授写的，名叫《食用菌王国》(The mushroom Kingdom)的书里找到。在这本书里，感兴趣的读者将可以发现关于食用菌种植历史的详细描述，而且还有一些关于种植，处理和储存的信息和建议。
今天，世界上食用菌产量大约一年达到80万吨。包括许多国家如欧洲、亚洲、南北美洲、非洲和澳大利亚。为此，科研机构和咨询中心一同建立起试点站，来进行科研攻关，培养食用菌种植专家并为工厂化食用菌提供咨询服务。为了保证在每个拥有食用菌产业的国家进行有效的实施管理这些行动，从而建立了食用菌种植者协会。
